ДНК-штрихкоды
африканских крыланов (Mammalia,
Pteropodidae). Митохондриальный геном не показывает
значимых различий между Epomophorus
gambianus и Micropteropus pusillus / DNA barcoding
of African fruit bats (Mammalia, Pteropodidae). The mitochondrial
genome does not provide a reliable discrimination between Epomophorus
gambianus and Micropteropus pusillus: Nesi, N., Nakouna,
E., Cruaud, C., Hassanin, A. - Comptes
Rendus Biologies, 334(7): 544-554, 2012.
|
Показано, что последовательности митохондриального
гена I субъединицы цитохром-с оксидазы (COI ) являются хорошим маркером
для видовой диагностики в разных группах животных. Однако метод
ДНК-штрихкодов ранее не тестировался на африканских фруктоядных
рукокрылых из семейства Pteropodidae (Mammalia, Chiroptera). В настоящем
исследовании последовательности гена COI были получены для 120 крыланов,
добытых в Центрально-Африканской Республике и принадлежащих к Epomophorus
gambianus и Micropteropus pusillus, двум видам, прекрасно
различающимся по морфологическим признакам, таким как размеры тела,
форма черепа и небные валики. Для сравнения результатов были использованы
два других молекулярных маркера: полная последовательность митохондриального
гена цитохрома-b и седьмой интрон ядерного гена бетта-фибриногена
(FGB). Наши результаты продемонстрировали неожиданные противоречия
между митохондриальными и ядерными генами. Сигнал гена FGB полностью
соответствует с морфологическими определениями; три аллеля этого
гена, выявленные у E. gambianus, отличаются от четырнадцати
аллелей, найденных у M. pusillus. Напротив, эти таксономические
различия вовсе не были показаны при анализе митохондриальных генов,
демонстрирующих полифилетический паттерн для обоих видов. Противоречия
между молекулярными маркерами объясняется множественной интрогрессией
мтДНК M. pusillus в E. gambianus или, как альтернатива,
неполной сортировкой предковых митохондриальных гаплотипов в сочетании
с положительным отбором аллелей FGB у M. pusillus. Наша работа
показывает неспособность ДНК-штрихкодов различить два морфологически
обособленных вида крыланов и демонстрирует важность одновременного
использования митохондриальных и ядерных маркеров для таксономической
идентификации..
Sequences of the mitochondrial cytochrome c oxidase
subunit I (COI ) gene have been shown to be useful for species identification
in various groups of animals. However, the DNA barcoding approach
has never been tested on African fruit bats of the family Pteropodidae
(Mammalia, Chiroptera). In this study, the COI gene was sequenced
from 120 bats cllected in the Central African Republic and belonging
to either Epomophorus gambianus or Micropteropus pusillus,
two species easily diagnosed on the basis of morphological characters,
such as body size, skull shape and palatal ridges. Two additional
molecular markers were used for comparisons: the complete mitochondrial
cytochrome b gene and the intron 7 of the nuclear betta-fibrinogen
(FGB) gene.Our results reveal an unexpected discordance between
mitochondrial and nuclear genes. The nuclear FGB signal agrees with
our morphological identifications, as the three alleles detected
for E. gambianus are divergent from the fourteen alleles
found for M.pusillus. By contrast, this taxonomic distinction
is not recovered with the analyses of mitochondrial genes, which
support rather a polyphyletic pattern for both species. The conflict
between molecular markers is explained by multiple mtDNA introgression
events from M. pusillus into E. gambianus or, alternatively,
by incomplete lineage sorting of mtDNA haplotypes associated with
positive selection on FGB alleles of M. pusillus. Our work
shows the failure of DNA barcoding to discriminate between two morphologically
distinct fruitbat species and highlights the importance of using
both mitochondrial and nuclear markers for taxonomic identification.
|