Карл Францевич Рулье (1814-1858)
В 1840 г. заведовать Кабинетом был призван Карл Францевич Рулье, прежде служивший при Медико-хирургической академии и заведовавший там музеем. Это был неординарный человек – яркий популяризатор естественнонаучных знаний, большой любитель живой природы, приверженец того, что сейчас было бы названо экологическим стилем мышления. Он прекрасно осознавал взаимосвязь всего и вся в природе, важность пристального внимания к самой малой "козявочке", к тому, кто живет под боком, а не где-то там, за морями в жарких странах. Это привело Рулье к представлению о том, что основой музейного собрания как одного из источников, питающих естествоиспытателей представлениями о гармонии и многообразии устройства природы, должны быть не единичные экспонаты, а серийные коллекционные сборы.
С начала 1840-х гг. поступления новых коллекций в музей стали регулярными и нередко весьма объёмными. Очень важно, что материалы тех лет были уже снабжены этикетками с информацией, позволяющей судить о происхождении экземпляра и о коллекторе. Это своего рода "документ", подтверждающий, что данный экземпляр пойман в данном месте в данное время.
По этой причине некоторые коллекционные экземпляры, сохранённые в музее с тех лет до наших дней, имеют исключительную историческую и научную ценность как свидетельства былого распространения некоторых видов животных. Так, в поступившем из Крыма значительном собрании тушек птиц имеется птенец большого кроншнепа (Numenius arquata) – неоспоримое доказательство того, что этот кулик в середине XIX столетия гнездился в Крыму, где его сейчас нет. Эти уникальные материалы поступили в музей от И.Н. Шатилова – выдающегося агронома и лесовода, одно время возглавлявшего Императорское Московское общество сельского хозяйства. Позже, в 1869 г. он был избран почётным членом Московского университета за содействие в пополнении собрания музея научными коллекциями.
Активность и известность Рулье как естествоиспытателя послужила стимулом к активному росту музейных фондов, а с ними – и авторитета Кабинета естественной истории в научных кругах. Усилиями Рулье в 1845 г. частью университетского собрания стали коллекции музея Медико-хирургической академии, насчитывавшие более 15 тысяч предметов. К концу 1850-х гг. в зоологическом разделе Кабинета естественной истории хранилось уже более 65 тысяч экземпляров животных.
Согласно печатным отчётам университета, в те годы интересные коллекции привозили Г.С. Карелин из Сибири, Джунгарии и с Каспийского моря, А. Нордман – с Украины, Молдавии и Кавказа, А. Романовский и И.А. Куприянов – из русских владений в Северной Америке.